Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf144aQ925F3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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