Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clip1Q922J3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clip1Q922J3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms