Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms