Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Smg8Q8VE18 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Smg8Q8VE18 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smg8Q8VE18 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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