Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms