Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh10Q8VCH7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms