Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnajc28Q8VCE1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms