Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
OptnQ8K3K8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms