Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MyripQ8K3I4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms