Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ncapd2Q8K2Z4 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms