Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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