Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Znf628Q8CJ78 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Znf628Q8CJ78 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Znf628Q8CJ78 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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