Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx8Q8CFD4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms