Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm9060-201ENSMUST00000120926 805 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 CT573085.2-201ENSMUST00000226097 552 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Cbx3-203ENSMUST00000114445 1585 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trim35Q8C006 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trim35Q8C006 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trim35Q8C006 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm12691-202ENSMUST00000222516 918 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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