Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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