Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lrfn4Q80XU8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms