Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Arhgef17Q80U35 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Arhgef17Q80U35 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arhgef17Q80U35 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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