Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ube2q1Q7TSS2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ube2q1Q7TSS2 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ube2q1Q7TSS2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ube2q1Q7TSS2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ube2q1Q7TSS2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ube2q1Q7TSS2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ube2q1Q7TSS2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2q1Q7TSS2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ube2q1Q7TSS2 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms