Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ckap2lQ7TS74 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms