Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trpv1Q704Y3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms