Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnih3Q6ZWS4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms