Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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