Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tpm4Q6IRU2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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