Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Krt40Q6IFX3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Krt40Q6IFX3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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