Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nop58Q6DFW4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop58Q6DFW4 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms