Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CltcQ68FD5 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms