Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sema3cQ62181 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sema3cQ62181 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sema3cQ62181 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sema3cQ62181 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sema3cQ62181 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sema3cQ62181 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sema3cQ62181 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms