Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ift88Q61371 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ift88Q61371 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ift88Q61371 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ift88Q61371 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ift88Q61371 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ift88Q61371 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ift88Q61371 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ift88Q61371 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ift88Q61371 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ift88Q61371 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ift88Q61371 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ift88Q61371 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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