Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Klf3Q60980 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Klf3Q60980 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms