Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rbbp4Q60972 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rbbp4Q60972 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms