Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cnot7Q60809 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cnot7Q60809 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cnot7Q60809 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cnot7Q60809 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cnot7Q60809 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cnot7Q60809 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cnot7Q60809 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cnot7Q60809 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cnot7Q60809 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cnot7Q60809 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cnot7Q60809 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnot7Q60809 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms