Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mkrn3Q60764 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms