Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samhd1Q60710 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms