Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sin3aQ60520 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sin3aQ60520 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms