Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vmn1r223Q5SSA0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 327.1 ms