Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Trappc1Q5NCF2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
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