Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Rtl6Q505G4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rtl6Q505G4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rtl6Q505G4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rtl6Q505G4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rtl6Q505G4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rtl6Q505G4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rtl6Q505G4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rtl6Q505G4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rtl6Q505G4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rtl6Q505G4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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