Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Foxn3Q499D0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms