Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pydc3Q3V3Q4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms