Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc185Q3V118 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms