Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ankrd42Q3V096 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms