Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms