Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms