Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Parp8Q3UD82 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms