Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rnf149Q3U2C5 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf149Q3U2C5 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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