Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc10Q3TLI0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc10Q3TLI0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms