Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Usp39Q3TIX9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms