Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Trappc13Q3TIR1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Trappc13Q3TIR1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Trappc13Q3TIR1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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