Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Fam107bQ3TGF2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Fam107bQ3TGF2 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Fam107bQ3TGF2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Fam107bQ3TGF2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam107bQ3TGF2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms