Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trim71Q1PSW8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms